El balonmano, como otros deportes en Arrasate, comenzó su andadura de la mano de la conocida institución local Juventud Deportiva de Mondragón, legando a tener un equipo senior y otro juvenil. Pero la sección de balonmano sólo duro 4 años. El interés por el balonmano lo habían traido estudiantes como Barriocanal y Zuazubiscar tras estudiar ingeniería en Valladolid, donde conocieron este singular deporte.

Se retomó la actividad de la mano de algunos jugadores de la etapa previa (Mikel Garay, Faustino Gorostiza, Juan Mari Errasti), liderados por Jose Antonio Aramburuzabala, primer presidente del club, y Jesús María Herrero “Pitxi”, todos ellos de la cuadrilla “Makilak”. Fuera de la órbita de Juventud Deportiva, el equipo comenzó ya ha denominarse ARRASATE ESKU BALOI jugando el campeonato territorial. En esta autonomía había que contar con financiación propia y aparecieron los primeros patrocinadores, como La Cepa Riojana.

El 16 de noviembre de 1981 los primeros estatutos del club se hacen oficiales en el Registro de Asociaciones y Federaciones deportivas del Consejo Superior de Deportes. En 1984, gracias al empuje de “Pitxi” Herrero, se consiguió un convenio de colaboración con el comercio ARRASATE KIROLAK que durante muchos años dió su nombre a los equipos de balonmano de Arrasate. El 18 de marzo de 1986 se depositan los estatutos en el Registro de Asociaciones y Clubs deportivos del Gobierno Vasco. Se creó el primer equipo femenino, que si bien no duró mucho puso los cimientos para los futuros equipos (2004-2008 y los actuales).

La entrada de Mariano Arrieta en 1993 sustituyendo a Jose Antonio Aramburuzabala en la presidencia, implantando un nuevo modelo de gestión y aplicando nuevas ideas empresariales, dió un impulso al club y llevó al equipo senior a militar en Primera Nacional en la temporada 1994-1995.

La muerte en 2004 de Pitxi Herrero, “alma mater” del balonmano de Arrasate, supuso un revés muy importante. Pero con la ayuda de un puñado de amigos y simpatizantes, como ANDONI ARANDO, AGUSTÍN RODRÍGUEZ y JUAN LUIS ISASMENDI, el club pudo continuar su andadura. En 2007 Mariano Arrieta cedió el testigo a INÉS AZPIAZU, actual presidenta del club.

A partir de 2010 comenzó la etapa de mayores éxitos deportivos del club, de tal manera que el equipo senior disputó las fases de ascenso a Primera Nacional en 2011, 2012 y 2013. Ese último año el equipo consiguió en Santoña alzarse con el primer puesto y por tanto el ascenso al Campeonato Estatal de Primera Nacional. Tras 2 temporadas en Primera, con muy buenos resultados, el club tomó la decisión de jugar en Segunda Nacional, donde milita ahora, más acorde con el nivel competitivo actual.